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Espèces animales

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    Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur le service écosystémique de pollinisation Protocole : Dépôt de plants de radis en fleurs en bordure de parcelle, laissés libres à la pollinisation ou non, puis récolte et pesage des graines Article de référence : Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in Western Europe, Annika L. Hass, Urs G. Kormann, Teja Tscharntke, Yann Clough, Aliette Bosem Baillod, Clélia Sirami, Lenore Fahrig, Jean-Louis Martin, Jacques Baudry, Colette Bertrand, Jordi Bosch, Lluís Brotons, Françoise Burel, Romain Georges, David Giralt, María Á. Marcos-García, Antonio Ricarte, Gavin Siriwardena and Péter Batáry. Proceedings of the Royal Society London B, 14 février 2018. DOI : 10.1098/rspb.2017.2242 Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    Conséquences de l’intensification agricole sur l’abondance de deux rapaces diurnes : la buse variable (Buteo buteo) et le faucon crécerelle (Falco tinnunculus) (Depuis 2004): Suivi par méthode IPA et IKA de l’abondance de deux espèces de rapaces diurnes dans 3 contextes paysagers contrastés ZAA et polders de la Baie du Mont st Michel Suivi IPA-IKA permanent tous les deux mois depuis décembre 2004 (suivi mensuel au cours de l’année 2005) Article de référence : -Butet, A., Michel, N., Rantier Y., Comor, V., Hubert-Moy, L., Nabucet, J., Delettre, Y. 2010. Responses of Common Buzzard (Buteo buteo) and Eurasian Kestrel (Falco tinnunculus) to land use changes in agricultural landscapes of Western France. Agriculture, Ecosystems and Environment, 138: 152-159. Programme : Programme national ANR-ECCO (CNRS INSU) « Dynamique des paysages et interactions proies-prédateurs (petits mammifères, rapaces). Conséquences de l’intensification agricole sur l’architecture des réseaux trophiques et les transferts de biomasse.

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    Objectif : Estimer l’abondance relative de micromammifères et leur portage pour certains agents pathogènes transmis par les tiques dans la Zone Atelier Armorique dans le cadre du programme de recherche OSCAR (Outil de Simulation Cartographique à l’échelle du paysage Agricole du Risque acarologique – 2012-2015). Nature de la donnée : Série de cinq échantillonnages : -Mai-Juin 2012 -Octobre 2012 -Mai-Juin 2013 -Septembre-Octobre 2013 -Mai 2014 Protocole : Pose de 34 pièges INRA sur vingt-quatre lignes de 100 mètres placées dans différents types de paysage (forêt, lisière de forêt, bocage ouvert et dense le long de lisières de bois ou de haies) puis relevés à 24 et 48 heures. Les animaux piégés ont subi une prise de sang puis ont été sacrifiés pour réaliser par la suite des analyses moléculaires sur différent organes (détection de Borrelia burgdoreferi sl., Anaplasma phagocytophylum et Babesia microti). Référence protocole : Michel, N., F. Burel, and A. Butet. 2006. How does landscape use influence small mammal diversity, abundance and biomass in hedgerow networks of farming landscapes? Acta Oecologica 30:11–20. 10.1016/j.actao.2005.12.006 Pas d'article de référence. OSUR - UMR Ecobio 6553 université de Rennes 1-CNRS — UMR BioEpAR1300 Oniris-INRA

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    Communautés de prédateurs (carabes et araignées) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de prédateurs (carabes et araignées) Protocole : Échantillonnage par pièges à fosse (Barber) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Bertrand, C., Burel, F., & Baudry, J. (2016). Spatial and temporal heterogeneity of the crop mosaic influences carabid beetles in agricultural landscapes. Landscape Ecology, 31(2), 451-466. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    "Cartographie des pratiques agricoles et des insectes auxiliaires (sud Ille et Vilaine) - ZAAr" L’objectif de ce projet est d’évaluer les effets de la diversité et de l’organisation spatiale des pratiques en Agriculture Biologique et en Agriculture Conventionnelle dans des systèmes de polyculture-élevage bretons sur les insectes auxiliaires, à l’échelle de la parcelle et du paysage. Dans 80 paysages d’Ille et Vilaine sud, un suivi des communautés d'auxiliaires (coccinelles, carabes, parasitoïdes) et des ravageurs du blé d'hiver (pucerons) a été réalisé entre avril et juillet, dans une parcelle de blé biologique et une parcelle de blé conventionnelle. Une cartographie précise de l’occupation du sol de chaque paysage a été réalisée, ainsi que des enquêtes avec les exploitants afin de relever les pratiques agricoles mises en œuvre dans les parcelles suivies et dans leur environnement paysager proche. Cette étude a été en partie financée par le projet ANR Landscaphid.

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    Importance des bandes enherbées dans le fonctionnement de la communauté des syrphes entomophages en sein des paysages agricoles Protocole : 10 couples de parcelles de blé échantillonnées : 10 avec présence de BE et 10 sans BE. Pour les 20 parcelles : 3 pièges jaune par parcelle à 20m de la bordure. Pièges distants de 10m Pour les 9 BE : 2 pièges jaunes espacés de 10m. Suivis de mi avril à mi juillet 2008 Article de référence : Ernoult A, Vialatte A, Butet A, Michel N, Rantier Y, Jambon O, Burel F (2013). Grassy strips in their landscape context, their role as new habitat for biodiversity, Agriculture, Ecosystems & Environment, 166: 15-27 Programme interdisciplinaire CNRS CEMAGREF Ingénierie Écologique

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    Objectif : Ces données, issues d’une thèse (Andrade 2013), portent sur l’analyse des dimensions spatiales et temporelles du fonctionnement et de la diversité taxonomique et fonctionnelle d’une guilde écologique. Protocole : Collecte de momies (à vue dans le champ). Détermination des émergents sous loupe binoculaire. Construction du réseau trophique (2 méthodes : -R : .package "bipartite". http://cran.r-project.org/web/packages/bipartite/bipartite.pdf. Avec ce package, on peut assez rapidement construire un RTQ (réseau trophique quantitatif) avec une matrice du type hôte x parasitoïde, et la commande plotweb. -Méthode Editeur d’images : La méthode que j'ai utilisée exige un logiciel d'édition d'images. J'ai choisi d'utiliser Artweaver ( http://www.artweaver.de/en ), qui est un petit logiciel simple, efficace et gratuit. Sous ce logiciel, je commence par créer des barres de 50 pixels de hauteur et de X pixels de longueur, X correspondant au nombre de hôtes ou de parasitoïdes d'une espèce donnée dans mon réseau. Ensuite, pour créer les flèches, je commence par créer des barres de 2 pixels de hauteur x Y pixels de longueur, où Y est proportionnel au nombre d'interactions hôte-parasitoïde. Quand toutes les barres ont été correctement positionnées (à l'aide de la grille sous Artweaver, par exemple), je trace des flèches à partir des bases grises (barres de 2 pixels de hauteur), formant des triangles dont un angle se situe au milieu de chaque barre de parasitoïde. Ces flèches sont ensuite remplies. Le réseau trophique est disponible dans la thèse (lien ci-dessous). Article de référence : thèse de doctorat de l’université de Rennes 1. Thiago Andrade 2013. (http://tel.archives-ouvertes.fr/index.php?halsid=lnrmlg478b4ubl8k7lm7k7am36&view_this_doc=tel-00971811&version=1) Programme de recherche : Projet ANR Landscaphid (2010-2013)

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    Communautés de papillons en paysage agricole (Ille et Vilaine, 2013-2014) Zone Atelier Armorique ZAAr: Objectif : Étude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de papillons Protocole : Inventaire le long d’un transect en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Sirami, C., Gross, N., Baillod, A. B., Bertrand, C., Carrié, R., Hass, A., ... & Fahrig, L. (2019). Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33), 16442-16447. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland

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    "Diversité gamma des carabes (Nord Ille et Vilaine, 2011) Zone Atelier Armorique ZAAr" Caractérisation de la diversité gamma des carabes du Nord de l’Ille et Vilaine (2011) Effet de l’hétérogénéité paysagère sur la diversité gamma : le cas des carabes. 20 mailles paysagères ont été choisies. Pour chaque maille : 5 habitats échantillonnés : les bois, les prairies permanentes, les prairies temporaires, les cultures et les haies. Pour mesurer la diversité gamma, 2 réplicats de chaque habitat ont été choisis : 10 relevés par maille.Plusieurs sessions de piégeage ont eu lieu entre mai et septembre 2011. Protocole : 2 pièges Barber par point d’échantillonnage, 4 périodes d’échantillonnage pour les céréales d’hiver, 6 périodes d’échantillonnage pour les autres types d’habitat. Les périodes d’échantillonnage correspondent à une ouverture des pièges pendant 1 semaine. Les relevés ont été réalisés entre Mai et Septembre 2011 Programme : Agriconnect (programme DIVA du ministère de l'environnement) Article de réf : Duflot R, Georges R, Ernoult A, Aviron S, Burel F. (2014) Landscape heterogeneity as an ecological filter of species traits. Acta Oecologica, 56: 19-26.

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    Communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) en paysage agricole, Ille et Vilaine (2013-2014): Objectif : Etude de l’effet de l’hétérogénéité de la mosaïque des cultures sur les communautés de pollinisateurs (bourdons, abeilles, syrphes) Protocole : Echantillonnage par coupelles colorées (Pan Traps) en bordure et au centre de parcelles agricoles Article de référence : Hass, A. L., Kormann, U. G., Tscharntke, T., Clough, Y., Baillod, A. B., Sirami, C., ... & Batáry, P. (2018). Landscape configurational heterogeneity by small-scale agriculture, not crop diversity, maintains pollinators and plant reproduction in western Europe. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 285(1872), 20172242. Programme de Recherche : ERA-Net BiodivERsA, Farmland